De Antonius van Paduakerk is een in kruisverband gemetselde kerk. Een kruisbasiliek met een hoog opgaand schip en lagere zijbeuken. De kerk heeft dubbele transeptarmen; deze worden op de kruising met het schip overwelfd door een koepel met stervormig gewelf.
Zangbalkon
Het zevenzijdige koor heeft een kooromgang. Boven de kooromgang zijn luchtbogen aangebracht. Het koor wordt geflankeerd door twee kapellen, met driezijdige sluiting. Voor elke kapel is een zangbalkon aangebracht, dat geleed wordt door spitsbogen. De balkonnen worden afgesloten door een bakstenen ballustrade.
De kapitelen van de zuilen en bundelpijlers hebben hoofdzakelijk plantmotieven. Een aantal heeft beeldhouwwerk met de Evangelistensymbolen en één heeft het wapen van NIjmegen.
Citaat uit het rapport ter verwerving van de monumentenstatus:
"De kerk is van cultuurhistorische waarde voor de religieuze en algemene ontwikkeling van de stad Nijmegen. De kerk is ook een representatief voorbeeld van een vroeg ontwerp van Jos Margry. Het interieur is harmonieus en evenwichtig."